173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43791 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_43791  predicted protein  100 
 
 
273 aa  567  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.944774  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02715  conserved hypothetical protein  31.92 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.12399 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01596  conserved hypothetical protein  28.51 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145119 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11122  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0829795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
327 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 
316 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
306 aa  62  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  29.36 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02374  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.09284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.31 
 
 
324 aa  58.9  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  28.47 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  26.23 
 
 
284 aa  55.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  27.63 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.45 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  27.36 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.66 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 
326 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0384845  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 
349 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
314 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 
309 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  27.23 
 
 
318 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  27.23 
 
 
308 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  27.59 
 
 
300 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  27.54 
 
 
342 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.56 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0456  short-chain dehydrogenase  34.53 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03305  short chain dehydrogenase/reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14310)  22.31 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
336 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2407  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  27.81 
 
 
319 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04726  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G10790)  28.12 
 
 
453 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.934862 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10094  hypothetical protein  28.57 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.151541  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  26.99 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.32 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  25 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.77 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  30.07 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5464  short-chain dehydrogenase  33.81 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0590758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.62 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
303 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
326 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.49 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163833  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  26.37 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.41 
 
 
236 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6091  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50583  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  26.87 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.41 
 
 
319 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  25.87 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
308 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2069  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.82 
 
 
243 aa  45.8  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.86 
 
 
250 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.6 
 
 
320 aa  45.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209308  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  30.07 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17930  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  31.82 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.481868 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  30.33 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  27.03 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
232 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0295505  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  26.11 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  31.29 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1716  short chain dehydrogenase  28.47 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43764  predicted protein  25.66 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>