115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34425 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34425  predicted protein  100 
 
 		 358 aa  731    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49978  predicted protein  45.06 
 
 		 526 aa  280  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17829  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  36.87 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00336169  normal  0.02899 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44951  predicted protein  68.48 
 
 		 94 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  27.78 
 
 		 293 aa  89.4  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  29.6 
 
 		 325 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  25.47 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  27.27 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  27.95 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  28.24 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  28.4 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  24.49 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  38.24 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  31.97 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  25.36 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  30.43 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  26.69 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  26.34 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  26.34 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  27.39 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  27.35 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  26.56 
 
 		 303 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  26.67 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  26.67 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  26.27 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  26.27 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  26.12 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  26.94 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  36.79 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  26.95 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  26.59 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  27.24 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  23.46 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  28.24 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  24.3 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  21.22 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  26.95 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  24.3 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  28.86 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  26.94 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  25.26 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  26.45 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  24.3 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  27.13 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  27.05 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  26.88 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  23.89 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  35.92 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  26.61 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  28.45 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  24.8 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  22.18 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  25.66 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  36.08 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  34.23 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  27.04 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  24.46 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  30.65 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  27.78 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  25.71 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  25.48 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  23.02 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  32.41 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  26.8 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  26.8 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  23.35 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  30 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  26.44 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  26.72 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  26.67 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  26.25 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  27.33 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  25 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  26.64 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  26.44 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  26.44 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  22.59 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  29.52 
 
 		 321 aa  52.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  25.82 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  27.03 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  21.46 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  29.93 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  24.81 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  30.39 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  30.07 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  32.65 
 
 		 316 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  22.96 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  28.87 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  29.41 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  34.23 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  24.49 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0839  sodium/bile acid symporter family protein  31.03 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00253549  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  26.01 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  24 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  28.87 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  31.07 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  23.32 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  30.1 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  26.32 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  27.21 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>