64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44951 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44951  predicted protein  100 
 
 
94 aa  187  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243129  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34425  predicted protein  68.48 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49978  predicted protein  56.67 
 
 
526 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17829  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  46.81 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00336169  normal  0.02899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  33.33 
 
 
344 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  30.23 
 
 
325 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  31.76 
 
 
340 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  33.33 
 
 
297 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  30.23 
 
 
325 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  32 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  26.51 
 
 
292 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 
321 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  28.74 
 
 
310 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  32 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  30.95 
 
 
305 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  30.95 
 
 
305 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 
312 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  34.78 
 
 
335 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  31.4 
 
 
325 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  27.91 
 
 
293 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  32.88 
 
 
311 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  30.95 
 
 
301 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  32.43 
 
 
300 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  29.07 
 
 
321 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  32.88 
 
 
311 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  31.51 
 
 
319 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  29.41 
 
 
320 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  38.3 
 
 
320 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  27.96 
 
 
298 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  30.23 
 
 
322 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  30.23 
 
 
322 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  28.24 
 
 
289 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  30.23 
 
 
322 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  30.23 
 
 
322 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  30.23 
 
 
322 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  30.23 
 
 
322 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  31.51 
 
 
315 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  37.93 
 
 
315 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  25.3 
 
 
334 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  29.07 
 
 
322 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  27.66 
 
 
303 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  27.66 
 
 
300 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  27.4 
 
 
319 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  26.74 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  29.82 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  27.66 
 
 
303 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  29.76 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  29.82 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  27.66 
 
 
303 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  25.84 
 
 
296 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  32 
 
 
321 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  26.51 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  24.42 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  24.73 
 
 
291 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  34.67 
 
 
336 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  26.19 
 
 
329 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  28.77 
 
 
315 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  34.67 
 
 
319 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  28.77 
 
 
315 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  32.88 
 
 
356 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  30.67 
 
 
321 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  28.4 
 
 
303 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  31.51 
 
 
309 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  27.38 
 
 
322 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>