142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_14791 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_14791  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  440  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.667997  normal  0.0481257 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14271  extracellular solute-binding protein  80.47 
 
 		 353 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0614  extracellular solute-binding protein  80 
 
 		 353 aa  362  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11305  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1168  extracellular solute-binding protein  76.28 
 
 		 349 aa  347  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12321  ABC transporter for amino acids, substrate binding protein  75.35 
 
 		 349 aa  346  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0921639  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12151  ABC transporter for amino acids, substrate binding protein  70.23 
 
 		 349 aa  328  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0847  extracellular solute-binding protein  66.98 
 
 		 367 aa  311  6.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1809  extracellular solute-binding protein  66.05 
 
 		 353 aa  299  3e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0740  extracellular solute-binding protein  45.79 
 
 		 356 aa  210  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2522  family 1 extracellular solute-binding protein  47.66 
 
 		 355 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1998  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 343 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0338  extracellular solute-binding protein family 3  46.26 
 
 		 389 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000810551  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4667  extracellular solute-binding protein family 3  48.13 
 
 		 364 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0246  extracellular solute-binding protein  47.2 
 
 		 359 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1454  extracellular solute-binding protein  45.37 
 
 		 389 aa  197  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0715  extracellular solute-binding protein family 3  46.05 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.337122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1113  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.19 
 
 		 340 aa  193  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4005  extracellular solute-binding protein  43.98 
 
 		 389 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1108  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.19 
 
 		 341 aa  191  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0318  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transporter  42.52 
 
 		 338 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.762797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1563  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.65 
 
 		 341 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1760  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.65 
 
 		 341 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3923  putative amino-acid ABC transporter, substrate-binding protein  40.38 
 
 		 338 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1420  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 		 415 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217844  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4094  extracellular solute-binding protein  42.99 
 
 		 339 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0267267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2549  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  39.91 
 
 		 350 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216585  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0793  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.06 
 
 		 341 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2832  extracellular solute-binding protein family 3  40.38 
 
 		 353 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2558  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  39.91 
 
 		 338 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2071  extracellular solute-binding protein  39.44 
 
 		 344 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0757625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1695  extracellular solute-binding protein  42.13 
 
 		 411 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0207768  hitchhiker  0.000479364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6377  extracellular solute-binding protein family 3  40.85 
 
 		 337 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1004  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  39.91 
 
 		 340 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3397  hypothetical protein  43.78 
 
 		 345 aa  177  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167886  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2912  extracellular solute-binding protein  39.44 
 
 		 337 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.392971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4393  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5870  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.31 
 
 		 340 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1602  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.5 
 
 		 336 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2086  extracellular solute-binding protein family 3  41.86 
 
 		 363 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2062  extracellular solute-binding protein family 3  41.86 
 
 		 363 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1705  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.97 
 
 		 340 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.402619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3560  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 		 342 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.801082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1747  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.65 
 
 		 338 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.913718  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2892  extracellular solute-binding protein  39.72 
 
 		 345 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0042428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4673  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 341 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0393  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.65 
 
 		 338 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0323019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3679  extracellular solute-binding protein  39.25 
 
 		 345 aa  174  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2557  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.25 
 
 		 343 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5283  extracellular solute-binding protein family 3  41.31 
 
 		 344 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2503  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.19 
 
 		 338 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4546  extracellular solute-binding protein  40.65 
 
 		 336 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2324  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 		 344 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0627  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.65 
 
 		 338 aa  171  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4382  extracellular solute-binding protein  41.79 
 
 		 341 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.98504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4179  extracellular solute-binding protein family 3  38.32 
 
 		 350 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1297  general amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.09 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.65 
 
 		 338 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3988  extracellular solute-binding protein family 3  38.79 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4484  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 		 335 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1529  extracellular solute-binding protein  37.56 
 
 		 346 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4428  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 		 342 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0904  extracellular solute-binding protein  36.15 
 
 		 342 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.700259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0705  general L-amino acid-binding periplasmic protein  38.97 
 
 		 345 aa  168  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4552  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 		 342 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0741  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.31 
 
 		 343 aa  167  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0736  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.31 
 
 		 343 aa  167  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2551  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  40.47 
 
 		 341 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3606  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2136  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 339 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4587  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.09 
 
 		 341 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3462  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.09 
 
 		 341 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3754  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.09 
 
 		 341 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.248765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0438  extracellular solute-binding protein  37.09 
 
 		 341 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3563  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.09 
 
 		 341 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3652  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.09 
 
 		 341 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03126  predicted amino-acid transporter subunit  37.09 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03077  hypothetical protein  37.09 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0948  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.56 
 
 		 339 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3707  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 		 341 aa  165  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371845 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.56 
 
 		 339 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0973  extracellular solute-binding protein  37.56 
 
 		 343 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.846042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1406  extracellular solute-binding protein  38.03 
 
 		 339 aa  164  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1072  extracellular solute-binding protein  36.15 
 
 		 342 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0779  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2946  extracellular solute-binding protein family 3  39.25 
 
 		 344 aa  160  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2984  extracellular solute-binding protein  42.25 
 
 		 367 aa  161  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1640  extracellular solute-binding protein  36.15 
 
 		 337 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2899  extracellular solute-binding protein family 3  39.25 
 
 		 340 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.507436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2579  extracellular solute-binding protein  35.68 
 
 		 336 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171917  normal  0.200935 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3587  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 345 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0949603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0229  extracellular solute-binding protein family 3  34.91 
 
 		 341 aa  158  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0120  extracellular solute-binding protein  37.09 
 
 		 342 aa  158  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1255  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.68 
 
 		 342 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0975  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.09 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0561977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1253  putative amino acid-binding protein  35.68 
 
 		 341 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0233  extracellular solute-binding protein family 3  34.43 
 
 		 341 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2822  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  35.68 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02361  hypothetical protein  36.62 
 
 		 350 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14100  putative amino acid-binding protein  35.68 
 
 		 341 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.111954  normal  0.0628834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2818  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  34.74 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>