More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4152 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4152  ribosome recycling factor  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0904163  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  42.78 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 194 aa  160  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 187 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  44.94 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  45.73 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  41.67 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  42.13 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  44.25 
 
 		 182 aa  151  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  40.45 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  39.78 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  41.67 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  43.75 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2554  ribosome recycling factor  40.88 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  41.67 
 
 		 187 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  41.38 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  42.46 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  36.22 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  39.44 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  40 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  42.22 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  42.54 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1318  ribosome recycling factor  41.94 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0899133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  37.91 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  38.67 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  38.2 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  38.2 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0706  ribosome recycling factor  39.55 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000018395 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  38.33 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  38.76 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  40.44 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  38.59 
 
 		 184 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  40.23 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  38.33 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  40.23 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 182 aa  143  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  36.22 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  38.67 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  35.96 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  39.89 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  41.38 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  38.67 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  40.33 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  37.16 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  40.33 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  37.3 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  40.45 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  38.89 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  38.67 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  38.67 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  40 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  36.52 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  37.16 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1534  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0202403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1713  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.634528  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  40.44 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  35.14 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  38.67 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  40.23 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  37.3 
 
 		 185 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1649  ribosome recycling factor  39.89 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  41.28 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  36.52 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0586  ribosome recycling factor  37.57 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.138909  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  39.55 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  35.75 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  39.2 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  39.89 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  34.59 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  36.76 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  40.44 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38960  ribosome recycling factor  37.84 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  38.73 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>