More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1200 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  363  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  210  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 184 aa  210  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 183 aa  201  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  54.64 
 
 		 184 aa  201  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  52.81 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  56.25 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  52.25 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  50.84 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 186 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  51.4 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  54.19 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 182 aa  188  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  46.37 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 195 aa  185  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 182 aa  184  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 182 aa  181  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  50.29 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>