More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_05231 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  80.22 
 
 		 182 aa  307  5e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1649  ribosome recycling factor  78.57 
 
 		 182 aa  306  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  80.77 
 
 		 182 aa  303  6e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  80.22 
 
 		 182 aa  302  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  79.77 
 
 		 173 aa  287  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  75.27 
 
 		 182 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  74.73 
 
 		 182 aa  281  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  73.63 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  76.88 
 
 		 173 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  65.93 
 
 		 182 aa  257  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  65.38 
 
 		 182 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  66.29 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  65.73 
 
 		 181 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  62.64 
 
 		 182 aa  243  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  61.8 
 
 		 187 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  60.44 
 
 		 182 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  59.89 
 
 		 182 aa  227  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  57.87 
 
 		 184 aa  214  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  55.11 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  53.41 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  55.11 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  53.04 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  54.91 
 
 		 173 aa  199  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  52.51 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  54.29 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  50.86 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  49.14 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  50 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17100  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1486  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 184 aa  177  9e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>