More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1783 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  76.76 
 
 		 185 aa  303  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  58.79 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  53.55 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 183 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  48.57 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2602  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 194 aa  187  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 192 aa  187  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 187 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 187 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  49.42 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1346  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000999324  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 186 aa  184  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 192 aa  184  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1537  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.874625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1992  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1534  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0202403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>