More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2345 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 183 aa  217  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 184 aa  209  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  56.25 
 
 		 184 aa  208  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  207  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0121  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.466045  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  52.25 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 184 aa  190  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 187 aa  190  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 181 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 192 aa  180  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 182 aa  178  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 182 aa  177  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  45.6 
 
 		 225 aa  177  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 187 aa  177  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>