More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0445 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  362  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  75 
 
 		 183 aa  277  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  64.2 
 
 		 184 aa  244  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  59.22 
 
 		 184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  58.1 
 
 		 184 aa  207  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  55.17 
 
 		 174 aa  204  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 187 aa  197  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  53.22 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 184 aa  188  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  183  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  44.89 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1745  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 182 aa  180  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>