More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1512 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  85.95 
 
 		 185 aa  299  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 186 aa  239  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  58.79 
 
 		 184 aa  229  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  57.14 
 
 		 184 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  57.14 
 
 		 184 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  56.52 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  56.5 
 
 		 184 aa  217  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  56.67 
 
 		 181 aa  210  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  56.82 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 187 aa  204  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  54.7 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  53.14 
 
 		 176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  57.63 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  52.87 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  55.23 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 181 aa  190  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  48.09 
 
 		 225 aa  185  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl555  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.862763  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>