More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3706 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 184 aa  255  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  237  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  237  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  59.24 
 
 		 184 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 186 aa  231  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  60.34 
 
 		 174 aa  228  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  58.15 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  59.32 
 
 		 184 aa  225  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  224  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  224  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  60.77 
 
 		 184 aa  221  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  59.24 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 192 aa  216  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 184 aa  210  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 184 aa  210  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  202  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 181 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 181 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 183 aa  201  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2424  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00108894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  200  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>