More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3928 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  97.84 
 
 		 185 aa  362  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  63.59 
 
 		 192 aa  248  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 174 aa  197  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  193  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>