More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0609 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  100 
 
 		 174 aa  343  8.999999999999999e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  65.52 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  69.54 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  65.52 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  60.34 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  62.64 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  59.77 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  59.77 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 184 aa  217  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  60.92 
 
 		 185 aa  214  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  59.77 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  59.2 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  59.77 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  55.17 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  55.75 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  56.9 
 
 		 183 aa  205  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  55.75 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  55.75 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  55.17 
 
 		 185 aa  204  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  57.47 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  55.17 
 
 		 184 aa  204  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  52.87 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  57.47 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  59.65 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 185 aa  197  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  54.02 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  55.23 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  52.87 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  54.02 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  56.32 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  53.25 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  49.42 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  50 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  50 
 
 		 225 aa  185  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  184  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  50 
 
 		 182 aa  183  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  50 
 
 		 182 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 185 aa  182  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  181  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  181  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  50 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  180  7e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  180  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>