More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0647 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 184 aa  197  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 184 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 184 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  50 
 
 		 174 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  181  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  43.02 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  50.84 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  42.47 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  42.47 
 
 		 192 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  42.47 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  41.34 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  44.07 
 
 		 225 aa  166  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  44.13 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  44.38 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  43.82 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  44.13 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  41.48 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  42.05 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0463  ribosome recycling factor  45.62 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  43.93 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  44.69 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  43.82 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  41.48 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1149  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  41.94 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>