More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0687 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  57.38 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  54.4 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  57.69 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0978  ribosome recycling factor  62.57 
 
 		 180 aa  199  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618783  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  58.43 
 
 		 181 aa  197  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  53.98 
 
 		 184 aa  190  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  52.51 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  47.85 
 
 		 225 aa  180  9.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 185 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  49.42 
 
 		 173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  50.84 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  47.09 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  167  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 190 aa  167  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 190 aa  167  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  45 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  45 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  45 
 
 		 184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  45 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2387  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>