More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1853 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  98.35 
 
 		 182 aa  361  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  79.12 
 
 		 182 aa  304  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  80.22 
 
 		 182 aa  302  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1649  ribosome recycling factor  78.02 
 
 		 182 aa  302  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  82.66 
 
 		 173 aa  291  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  76.92 
 
 		 182 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  75.82 
 
 		 182 aa  282  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  75.82 
 
 		 182 aa  281  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  78.61 
 
 		 173 aa  277  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  62.09 
 
 		 182 aa  247  8e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  64.8 
 
 		 182 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  65.73 
 
 		 181 aa  240  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  63.19 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  65.17 
 
 		 181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  58.79 
 
 		 182 aa  229  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  58.43 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  56.04 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  56.07 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  52.02 
 
 		 173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  52.02 
 
 		 225 aa  197  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  51.4 
 
 		 184 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  54.34 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  53.98 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  52.02 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 192 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  46.37 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  46.37 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 182 aa  177  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  49.12 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  46.37 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 195 aa  174  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 173 aa  174  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  45.66 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  45.66 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  49.12 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  45.25 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  47.95 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  45.66 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  50.58 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  50.58 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  50.58 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  50.58 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>