More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0261 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 186 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  49.47 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.7 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  49.48 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 181 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  49.74 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 187 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 186 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  44.38 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 187 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  175  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  44.63 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 182 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 181 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  47.87 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  50.87 
 
 		 173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>