More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0581 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  100 
 
 		 184 aa  363  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  65.76 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  63.04 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  66.67 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  60.87 
 
 		 184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  59.24 
 
 		 185 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  58.47 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  59.78 
 
 		 184 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  57.61 
 
 		 185 aa  224  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  59.67 
 
 		 184 aa  223  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  60.33 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 174 aa  217  8.999999999999998e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  57.8 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  57.63 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  58.19 
 
 		 185 aa  214  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  215  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  55.19 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 184 aa  207  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 192 aa  207  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  54.91 
 
 		 183 aa  204  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  201  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  54.64 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 173 aa  197  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  53.07 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 182 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 183 aa  191  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 182 aa  190  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 187 aa  190  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 187 aa  190  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 187 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  48.55 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  48.55 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>