More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1669 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  237  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 184 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  57.78 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  59.77 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 187 aa  217  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  59.78 
 
 		 184 aa  214  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  56.35 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  58.24 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 186 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  211  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 184 aa  205  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 192 aa  198  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  55.17 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  194  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 184 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 184 aa  190  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 187 aa  187  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  47.83 
 
 		 225 aa  186  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>