More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0528 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  254  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  61.41 
 
 		 192 aa  237  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  217  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  54.12 
 
 		 173 aa  191  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 184 aa  187  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  51.7 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  50 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 186 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  50 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  50 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2602  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0348  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000142199  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>