More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0356 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  100 
 
 		 173 aa  349  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  95.38 
 
 		 185 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  93.64 
 
 		 185 aa  334  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  56.07 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 186 aa  208  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 184 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 185 aa  201  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  55.29 
 
 		 186 aa  200  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 184 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  54.34 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 186 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  191  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 187 aa  191  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 192 aa  191  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  54.12 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 182 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  52.35 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  54.71 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 184 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  50.59 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  46.82 
 
 		 176 aa  177  9e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 182 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  48.24 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  48.24 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 182 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 182 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 185 aa  174  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 184 aa  174  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  47.06 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  48.82 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 187 aa  174  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1649  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 182 aa  173  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 185 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 182 aa  171  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  44.51 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  44.51 
 
 		 225 aa  171  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 173 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 186 aa  170  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  48.5 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 187 aa  170  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  51.2 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  43.93 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  43.93 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>