More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0507 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  100 
 
 		 182 aa  363  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  75.82 
 
 		 187 aa  295  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  71.98 
 
 		 182 aa  285  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  74.18 
 
 		 182 aa  286  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  74.18 
 
 		 182 aa  283  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  72.22 
 
 		 181 aa  280  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  71.67 
 
 		 181 aa  278  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  67.03 
 
 		 182 aa  263  8e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  65.93 
 
 		 182 aa  257  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  68.79 
 
 		 173 aa  256  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  65.93 
 
 		 182 aa  256  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1649  ribosome recycling factor  63.74 
 
 		 182 aa  255  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  64.84 
 
 		 182 aa  251  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  63.19 
 
 		 182 aa  248  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  63.74 
 
 		 182 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  62.64 
 
 		 182 aa  248  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  62.09 
 
 		 182 aa  247  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  65.32 
 
 		 173 aa  244  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  56.67 
 
 		 184 aa  213  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  58.99 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  56.67 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  57.23 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  56.07 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  56.07 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  56.07 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 184 aa  204  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  55 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  54.91 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  54.91 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  53.18 
 
 		 173 aa  200  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  52.25 
 
 		 225 aa  199  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  54.34 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 184 aa  197  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  53.18 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  52.27 
 
 		 184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  50 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 192 aa  191  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  52.27 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 184 aa  190  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 173 aa  189  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 174 aa  187  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  50 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  50 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  51.7 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  54.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  54.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  52.84 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  52.27 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>