More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2291 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  238  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  60.44 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 186 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  214  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  214  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  213  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  210  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 184 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  55.11 
 
 		 183 aa  201  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 184 aa  201  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 184 aa  201  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  197  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 187 aa  197  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  55.11 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 184 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 184 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  57.63 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 187 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 182 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 187 aa  184  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 182 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  49.72 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  50 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 182 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0978  ribosome recycling factor  53.98 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  49.71 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  52.27 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl555  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.862763  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0706  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000018395 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 173 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  174  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 187 aa  174  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>