More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0010 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  100 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 184 aa  207  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  54.14 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 184 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  197  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  194  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  191  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2999  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 186 aa  188  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  49.48 
 
 		 195 aa  184  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 174 aa  181  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 185 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  48.13 
 
 		 187 aa  180  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04050  ribosome recycling factor  45.99 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.647484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  45.7 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  42.54 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  50 
 
 		 183 aa  177  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2387  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1413  ribosome recycling factor  45.99 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.889728  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 184 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  46.86 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  45 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  44.94 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>