More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1351 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2387  ribosome recycling factor  55.38 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2999  ribosome recycling factor  54.3 
 
 		 186 aa  211  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0578  ribosome recycling factor (ribosome releasing factor)  52.15 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 187 aa  201  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 187 aa  201  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04050  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.647484  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 184 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.26 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 174 aa  177  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  43.85 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 186 aa  174  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  47.06 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  47.59 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  47.09 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  45.66 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 182 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  48.26 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  48 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2973  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 187 aa  167  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>