More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1370 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  94.05 
 
 		 185 aa  346  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  71.89 
 
 		 185 aa  280  7.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  68.11 
 
 		 185 aa  271  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 185 aa  270  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  267  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  65.95 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  67.39 
 
 		 186 aa  264  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  247  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  241  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  240  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  240  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  238  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  238  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  234  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  232  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  230  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  56.74 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  56.74 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 188 aa  198  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 184 aa  188  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  50.29 
 
 		 176 aa  187  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 181 aa  171  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 182 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 174 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  45.65 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>