More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1866 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  78.92 
 
 		 185 aa  309  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  69.19 
 
 		 185 aa  283  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  280  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  70.81 
 
 		 185 aa  280  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  277  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  76.76 
 
 		 185 aa  275  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 185 aa  274  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  68.11 
 
 		 185 aa  272  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  70.27 
 
 		 185 aa  271  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  70.81 
 
 		 185 aa  269  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  269  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  267  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  254  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  251  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  64.32 
 
 		 185 aa  250  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  250  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  249  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  61.96 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  241  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  221  6e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  55.06 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  54.14 
 
 		 188 aa  205  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  52.81 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 184 aa  187  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  47.28 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>