More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2472 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  78.8 
 
 		 186 aa  317  5e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  65.22 
 
 		 184 aa  259  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 186 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  57.87 
 
 		 181 aa  218  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 186 aa  214  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  56.91 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  56.91 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  56.35 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  210  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  210  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  210  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 192 aa  195  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  49.46 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  50 
 
 		 183 aa  191  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 186 aa  190  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0788  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  56.32 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2545  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 182 aa  187  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1149  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 186 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 187 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  50.87 
 
 		 173 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 186 aa  184  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 182 aa  184  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>