More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1487 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  363  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  80 
 
 		 185 aa  310  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  75.68 
 
 		 185 aa  297  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  76.22 
 
 		 185 aa  293  8e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  72.97 
 
 		 185 aa  284  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 185 aa  277  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  70.65 
 
 		 186 aa  274  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  68.11 
 
 		 185 aa  264  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  67.03 
 
 		 185 aa  261  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  64.32 
 
 		 185 aa  261  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  258  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  247  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  237  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  237  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  234  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  62.43 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  56.18 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 186 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  48 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0788  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 189 aa  174  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  44.63 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  43.75 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  43.75 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>