More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10150 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  65.95 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  62.98 
 
 		 185 aa  240  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  64.41 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  63.04 
 
 		 185 aa  235  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  62.43 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  61.88 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  62.43 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  59.67 
 
 		 185 aa  215  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  54.14 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 183 aa  194  8.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 186 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  45.99 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  44.13 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1713  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.634528  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 182 aa  170  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  47.87 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 186 aa  168  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 187 aa  168  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  47.51 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  47.51 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>