More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0629 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  48.42 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 187 aa  181  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  48.95 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  46.29 
 
 		 176 aa  176  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  41.99 
 
 		 183 aa  174  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  42.11 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  45.99 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  45.09 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  45 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  45.35 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  45 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  43.68 
 
 		 184 aa  167  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  42.61 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  42.61 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  41.48 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  42.77 
 
 		 182 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  46.86 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  46.29 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  41.67 
 
 		 184 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  43.5 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  42.16 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  161  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  39.2 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  39.2 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  41.24 
 
 		 182 aa  160  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  39.13 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  44.89 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  41.14 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  41.11 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  41.3 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>