More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  78.38 
 
 		 185 aa  299  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  73.51 
 
 		 185 aa  282  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  72.43 
 
 		 185 aa  280  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  76.22 
 
 		 185 aa  274  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 185 aa  274  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 185 aa  270  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  70.11 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 185 aa  264  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  257  8e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  65.95 
 
 		 185 aa  254  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  253  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  246  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  245  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  243  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  243  9e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  237  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  234  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  62.43 
 
 		 188 aa  229  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  221  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  55.06 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  54.49 
 
 		 183 aa  203  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  50.29 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 182 aa  174  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 181 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 182 aa  170  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  44.89 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  45 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  45 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2602  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 186 aa  167  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  42.61 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1992  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  44.94 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>