More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1046 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  62.84 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  58.79 
 
 		 185 aa  234  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  54.29 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 186 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 187 aa  180  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  50 
 
 		 192 aa  177  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2387  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04050  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.647484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1594  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409738  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4183  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0788  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  48.57 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  48 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3050  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.672962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1441  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  48.57 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  48 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1534  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0202403 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1713  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.634528  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>