More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1901 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04050  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2387  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2999  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  48.65 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 181 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0578  ribosome recycling factor (ribosome releasing factor)  47.03 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 182 aa  170  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2973  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1992  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  43.55 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  43.35 
 
 		 187 aa  167  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1441  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2545  ribosome recycling factor  47.06 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>