More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0578 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0578  ribosome recycling factor (ribosome releasing factor)  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2999  ribosome recycling factor  57.53 
 
 		 186 aa  227  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2387  ribosome recycling factor  55.38 
 
 		 186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  52.15 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  53.63 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04050  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.647484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.66 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2973  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 184 aa  170  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1441  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 185 aa  167  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 187 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  44.94 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  45.99 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  44.94 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  44.63 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  43.93 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>