More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0305 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  83.33 
 
 		 188 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  82.8 
 
 		 188 aa  311  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  81.18 
 
 		 188 aa  307  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5315  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  51.34 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 195 aa  184  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  50.8 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1745  ribosome recycling factor  53.71 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  44.39 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  49.2 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  50 
 
 		 174 aa  177  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  48.66 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  48.9 
 
 		 225 aa  177  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  47.59 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  48.66 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  47.06 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  48.13 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  50.29 
 
 		 173 aa  174  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  47.06 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  47.59 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  49.41 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  47.59 
 
 		 186 aa  174  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  45.25 
 
 		 186 aa  174  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  45.99 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  51.2 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  49.11 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  52.44 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  51.2 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  47.06 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  47.06 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 191 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 186 aa  170  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  52.44 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1992  ribosome recycling factor  48.13 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  47.59 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.83 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>