More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0370 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2554  ribosome recycling factor  64.36 
 
 		 188 aa  251  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  59.22 
 
 		 186 aa  235  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  58.6 
 
 		 187 aa  228  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  59.36 
 
 		 191 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  57.78 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0586  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 186 aa  221  7e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.138909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 186 aa  220  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2458  ribosome recycling factor  55.85 
 
 		 243 aa  219  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 187 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1494  ribosome recycling factor  56.57 
 
 		 188 aa  214  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280653  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  55 
 
 		 187 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1363  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00468039 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2706  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.957438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2152  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  57.14 
 
 		 184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3994  ribosome recycling factor  53.07 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1413  ribosome recycling factor  53.63 
 
 		 187 aa  209  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.889728  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 186 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 186 aa  207  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  55.62 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 187 aa  205  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 187 aa  204  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 187 aa  204  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0463  ribosome recycling factor  58.79 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1372  ribosome recycling factor  59.63 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0601267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 187 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  51.06 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 187 aa  188  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  42.31 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  46.28 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  49.14 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  42.08 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  43.1 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  46.86 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  46.86 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  43.43 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 181 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  47.62 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  44.83 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  44.83 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  40.98 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  40.98 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  40.98 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  46.52 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  42.54 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>