More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1957 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0463  ribosome recycling factor  80.43 
 
 		 185 aa  293  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1372  ribosome recycling factor  77.17 
 
 		 185 aa  277  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0601267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  64.29 
 
 		 186 aa  249  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  60.99 
 
 		 186 aa  237  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  62.22 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  62.22 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  62.78 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  60.56 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  60.56 
 
 		 186 aa  232  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  61.88 
 
 		 187 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0586  ribosome recycling factor  63.07 
 
 		 186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.138909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  61.88 
 
 		 186 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  62.78 
 
 		 187 aa  230  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  62.01 
 
 		 186 aa  229  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  60.77 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  60.56 
 
 		 187 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  58.56 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  61.67 
 
 		 194 aa  227  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  62.36 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  61.67 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  60.56 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  60.34 
 
 		 186 aa  225  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  60 
 
 		 187 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  60.34 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  59.78 
 
 		 186 aa  221  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  58.01 
 
 		 187 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2554  ribosome recycling factor  60.23 
 
 		 188 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  57.14 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1413  ribosome recycling factor  55.87 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.889728  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3994  ribosome recycling factor  54.75 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  57.14 
 
 		 188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  56.99 
 
 		 188 aa  208  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2458  ribosome recycling factor  54.75 
 
 		 243 aa  205  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1363  ribosome recycling factor  53.71 
 
 		 188 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00468039 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2706  ribosome recycling factor  53.71 
 
 		 188 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.957438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2152  ribosome recycling factor  53.14 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1494  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 188 aa  200  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280653  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  53.98 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  51.4 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 186 aa  187  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  52.05 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1441  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  44.63 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  43.02 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.58 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 186 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 186 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>