More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1383 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  64.61 
 
 		 191 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  62.09 
 
 		 187 aa  245  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1413  ribosome recycling factor  61.17 
 
 		 187 aa  244  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.889728  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  59.68 
 
 		 186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  59.68 
 
 		 186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  60.22 
 
 		 186 aa  240  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1494  ribosome recycling factor  63.64 
 
 		 188 aa  240  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280653  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2458  ribosome recycling factor  62.77 
 
 		 243 aa  240  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401081 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0586  ribosome recycling factor  62.57 
 
 		 186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.138909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1363  ribosome recycling factor  60.66 
 
 		 188 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00468039 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3994  ribosome recycling factor  60.11 
 
 		 187 aa  238  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2152  ribosome recycling factor  60.66 
 
 		 188 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2706  ribosome recycling factor  60.66 
 
 		 188 aa  237  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.957438  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  59.22 
 
 		 188 aa  235  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  59.14 
 
 		 186 aa  235  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  58.6 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  58.6 
 
 		 186 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  58.06 
 
 		 186 aa  230  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  58.06 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  58.06 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  56.99 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  56.45 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  58.56 
 
 		 184 aa  228  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  58.79 
 
 		 187 aa  227  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 187 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  57.69 
 
 		 194 aa  225  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  56.04 
 
 		 187 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  55.38 
 
 		 186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  54.95 
 
 		 187 aa  224  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 187 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  56.83 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  56.28 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  60.8 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  54.4 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2554  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 188 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0463  ribosome recycling factor  58.58 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1372  ribosome recycling factor  57.83 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0601267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 186 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  50.84 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  45.25 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 184 aa  174  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>