More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0586 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0586  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  376  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.138909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  77.96 
 
 		 186 aa  297  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  77.96 
 
 		 186 aa  297  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  74.73 
 
 		 186 aa  287  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  72.04 
 
 		 186 aa  280  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  72.22 
 
 		 186 aa  275  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 186 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  70.79 
 
 		 186 aa  267  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  70.79 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  63.44 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  61.8 
 
 		 187 aa  240  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  62.5 
 
 		 187 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  61.24 
 
 		 187 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  62.57 
 
 		 186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  62.78 
 
 		 187 aa  237  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  61.29 
 
 		 186 aa  235  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  63.48 
 
 		 187 aa  234  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  61.11 
 
 		 187 aa  234  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  62.78 
 
 		 194 aa  233  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  60 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  60.56 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  60 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  61.11 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  59.44 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  59.68 
 
 		 186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  63.07 
 
 		 184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  60.56 
 
 		 187 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 188 aa  221  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 191 aa  220  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2152  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 188 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1363  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00468039 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2706  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 188 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.957438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0463  ribosome recycling factor  61.82 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1413  ribosome recycling factor  56.98 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.889728  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2554  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 188 aa  214  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1494  ribosome recycling factor  56.82 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280653  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3994  ribosome recycling factor  54.19 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2458  ribosome recycling factor  54.75 
 
 		 243 aa  203  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1372  ribosome recycling factor  60.25 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0601267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  54.7 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 186 aa  184  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 186 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 186 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  49.18 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  49.18 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>