More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1159 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  93.55 
 
 		 186 aa  356  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0586  ribosome recycling factor  77.96 
 
 		 186 aa  297  7e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.138909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  71.51 
 
 		 186 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  70.43 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  68.82 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  69.89 
 
 		 186 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  67.2 
 
 		 186 aa  268  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  67.58 
 
 		 187 aa  264  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  66.48 
 
 		 187 aa  263  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 187 aa  257  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  63.98 
 
 		 186 aa  257  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  65.93 
 
 		 194 aa  257  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  66.48 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  63.98 
 
 		 187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  64.29 
 
 		 187 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  64.29 
 
 		 187 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  64.71 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  62.37 
 
 		 186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  63.74 
 
 		 187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  63.44 
 
 		 186 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  64.29 
 
 		 187 aa  250  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 187 aa  250  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  62.09 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  59.68 
 
 		 186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  62.22 
 
 		 184 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  59.69 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 188 aa  222  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0463  ribosome recycling factor  61.76 
 
 		 185 aa  220  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2152  ribosome recycling factor  56.04 
 
 		 188 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1363  ribosome recycling factor  56.04 
 
 		 188 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00468039 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2706  ribosome recycling factor  56.04 
 
 		 188 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.957438  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1413  ribosome recycling factor  54.26 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.889728  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3994  ribosome recycling factor  53.19 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1494  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280653  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1372  ribosome recycling factor  61.21 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0601267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2458  ribosome recycling factor  53.19 
 
 		 243 aa  208  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401081 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2554  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 188 aa  207  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  56.25 
 
 		 188 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  49.14 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2424  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00108894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  49.14 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>