More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0745 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  100 
 
 
185 aa  371  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50.27 
 
 
186 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.82 
 
 
185 aa  191  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  54.44 
 
 
184 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  50.27 
 
 
185 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  50.28 
 
 
184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  48.9 
 
 
187 aa  187  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  50 
 
 
183 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  50 
 
 
186 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  49.72 
 
 
187 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  53.89 
 
 
184 aa  184  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  50.28 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  48.35 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  50.56 
 
 
187 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  46.33 
 
 
186 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  48.88 
 
 
194 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  45.36 
 
 
185 aa  177  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  49.18 
 
 
185 aa  177  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  177  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  47.83 
 
 
184 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  48.6 
 
 
187 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  45.36 
 
 
185 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  47.75 
 
 
187 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  45.9 
 
 
185 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  47.19 
 
 
187 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  46.99 
 
 
185 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  46.74 
 
 
185 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  48.62 
 
 
185 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50.29 
 
 
184 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  45.9 
 
 
185 aa  175  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  46.07 
 
 
184 aa  175  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  45.51 
 
 
187 aa  175  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  49.15 
 
 
186 aa  174  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  44.26 
 
 
185 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  48.86 
 
 
186 aa  174  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.31 
 
 
185 aa  174  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  49.41 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  47.51 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  46.59 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  48.3 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  44.81 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  44.26 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  46.33 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  44.26 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  43.72 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  44.51 
 
 
187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  43.96 
 
 
187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  43.96 
 
 
187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  43.72 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  44.26 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  45.11 
 
 
185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  43.96 
 
 
187 aa  171  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  47.73 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  45.36 
 
 
185 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  47.19 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  46.02 
 
 
185 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  45.51 
 
 
185 aa  170  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  45.51 
 
 
182 aa  170  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  48.5 
 
 
173 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  45.25 
 
 
184 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  44.26 
 
 
185 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  47.73 
 
 
184 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  45.25 
 
 
184 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  46.07 
 
 
185 aa  170  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  46.78 
 
 
184 aa  169  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  45.76 
 
 
185 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  43.82 
 
 
182 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  48.85 
 
 
181 aa  169  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  44.81 
 
 
185 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  46.07 
 
 
186 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  47.98 
 
 
185 aa  169  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  45.76 
 
 
185 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  45.76 
 
 
185 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  45.76 
 
 
185 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
182 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  45.9 
 
 
185 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  44.57 
 
 
185 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  44.57 
 
 
185 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  45.36 
 
 
185 aa  168  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0706  ribosome recycling factor  48.5 
 
 
187 aa  168  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000018395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  43.75 
 
 
191 aa  168  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  45.35 
 
 
176 aa  168  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  45.98 
 
 
188 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  44.26 
 
 
185 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  44.26 
 
 
185 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  43.72 
 
 
185 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  43.72 
 
 
185 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  167  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  46.45 
 
 
185 aa  167  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  48.6 
 
 
184 aa  166  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>