More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2711 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  75.68 
 
 		 185 aa  290  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  73.51 
 
 		 185 aa  283  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  72.97 
 
 		 185 aa  281  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  72.43 
 
 		 185 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  70.81 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  70.27 
 
 		 185 aa  267  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  58.24 
 
 		 184 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  54.4 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  56.07 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 181 aa  187  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 195 aa  184  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1508  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 186 aa  180  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2280  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.704245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0232  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1781  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  47.54 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0361  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000245194  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>