More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2280 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2280  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.704245  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0341  ribosome recycling factor  75 
 
 		 185 aa  290  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2111  ribosome recycling factor  73.37 
 
 		 185 aa  284  4e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.274571  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1508  ribosome recycling factor  71.74 
 
 		 185 aa  278  3e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1781  ribosome recycling factor  66.85 
 
 		 185 aa  271  4.0000000000000004e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  69.02 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  68.48 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0361  ribosome recycling factor  70.11 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000245194  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0232  ribosome recycling factor  67.39 
 
 		 185 aa  264  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2067  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  43.55 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  42.62 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  43.75 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04050  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.647484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  41.3 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  40.88 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  41.3 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  45.09 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  41.48 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  43.75 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  41.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  41.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  45.14 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  41.94 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  45.09 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  45.09 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  44.69 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  44.69 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  44 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  41.53 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  41.4 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>