More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0285 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  98.92 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0232  ribosome recycling factor  97.84 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1508  ribosome recycling factor  89.73 
 
 		 185 aa  340  1e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0361  ribosome recycling factor  77.84 
 
 		 185 aa  297  7e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000245194  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2111  ribosome recycling factor  74.59 
 
 		 185 aa  291  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0341  ribosome recycling factor  75.68 
 
 		 185 aa  291  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418227  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1781  ribosome recycling factor  73.51 
 
 		 185 aa  288  3e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2280  ribosome recycling factor  68.48 
 
 		 186 aa  248  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.704245  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2067  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  49.12 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  47.09 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  48.26 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  45.35 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  45.35 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  44.13 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  40 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  42.62 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  41.53 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2545  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 196 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  46.78 
 
 		 173 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 187 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1745  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 187 aa  170  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  46.78 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>