More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1781 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  60.11 
 
 		 184 aa  234  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  57.61 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  56.52 
 
 		 186 aa  220  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 186 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  200  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 184 aa  197  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  54.7 
 
 		 184 aa  195  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 188 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3273  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  46.7 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 173 aa  177  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>