More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0281 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  96.81 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  96.28 
 
 		 188 aa  360  8e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  81.18 
 
 		 187 aa  307  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  54.39 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 184 aa  194  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 195 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5315  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1745  ribosome recycling factor  52 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  48.35 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 174 aa  174  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1163  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1447  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  49.71 
 
 		 173 aa  174  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  52.15 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  52.15 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.54 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2602  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  40.98 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1992  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  50.31 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 184 aa  170  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>