More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1430 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  100 
 
 		 184 aa  364  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  60.77 
 
 		 185 aa  237  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  59.67 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  64.25 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  61.24 
 
 		 185 aa  230  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  61.24 
 
 		 184 aa  229  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  61.24 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  62.36 
 
 		 186 aa  228  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  64.61 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  63.54 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  62.01 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  56.35 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  56.35 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  58.01 
 
 		 186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  62.01 
 
 		 185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  62.01 
 
 		 185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  61.45 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  60.89 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  60.89 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  60.89 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  60.89 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 186 aa  217  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  60.89 
 
 		 185 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  60.89 
 
 		 185 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  60.34 
 
 		 185 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  54.7 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 184 aa  214  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  57.39 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 184 aa  210  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  59.65 
 
 		 174 aa  210  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 192 aa  210  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  54.7 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 187 aa  201  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  54.7 
 
 		 185 aa  200  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  200  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  54.14 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  54.71 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  53.67 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  56.28 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  50.56 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 186 aa  193  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 185 aa  191  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0530  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  191  3e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>