More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3273 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3273  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 185 aa  167  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  44.69 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 182 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  46.51 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  43.43 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  45.93 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  43.5 
 
 		 182 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  47.67 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  44.13 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  42.31 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  44.13 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  42.22 
 
 		 184 aa  160  8.000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  46.96 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  43.75 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  47.67 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  47.37 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>